Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDH17Q12864 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDH17Q12864 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDH17Q12864 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDH17Q12864 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CDH17Q12864 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CDH17Q12864 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDH17Q12864 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDH17Q12864 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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