Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms