Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELF3P78545 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELF3P78545 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELF3P78545 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELF3P78545 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELF3P78545 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELF3P78545 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELF3P78545 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELF3P78545 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms