Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D1P54289 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms