Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TGFBR1P36897 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms