Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TSKSQ9UJT2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKSQ9UJT2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms