Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms