Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CADM1Q9BY67 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms