Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms