Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NKD2Q969F2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NKD2Q969F2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms