Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SUSD1Q6UWL2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms