Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKOR2Q2VWA4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKOR2Q2VWA4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms