Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNGB1Q14028 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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