Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IFFO1Q0D2I5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms