Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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