Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIOO75962 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIOO75962 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIOO75962 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIOO75962 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIOO75962 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIOO75962 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIOO75962 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIOO75962 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIOO75962 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIOO75962 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIOO75962 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIOO75962 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms