Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H3F3CQ6NXT2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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