Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
MSMPQ1L6U9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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