Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms