Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms