Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYTH4Q9UIA0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms