Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCDC71Q8IV32 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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