Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DCAF6Q58WW2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms