Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC9A1P19634 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms