Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB23Q9ULC3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms