Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SENP8Q96LD8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms