Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF548Q8NEK5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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