Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGDCC3Q8IVU1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGDCC3Q8IVU1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms