Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms