Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD300CQ08708 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms