Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKL1Q00532 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms