Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EDAQ92838 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EDAQ92838 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EDAQ92838 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EDAQ92838 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EDAQ92838 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EDAQ92838 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EDAQ92838 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms