Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RABGGTAQ92696 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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