Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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COL4A6Q14031 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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COL4A6Q14031 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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COL4A6Q14031 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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COL4A6Q14031 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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