Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FOXE3Q13461 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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