Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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