Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 398 ms