Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PLNP26678 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PLNP26678 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms