Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM63AO94886 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms