Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC169A6NNP5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms