Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DTX4Q9Y2E6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DTX4Q9Y2E6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms