Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms