Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF8Q3BBV2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms