Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
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