Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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GBX1Q14549 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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GBX1Q14549 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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GBX1Q14549 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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GBX1Q14549 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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GBX1Q14549 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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GBX1Q14549 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GBX1Q14549 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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GBX1Q14549 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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