Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRIM25Q14258 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRIM25Q14258 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRIM25Q14258 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRIM25Q14258 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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TRIM25Q14258 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TRIM25Q14258 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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TRIM25Q14258 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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