Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMAN2Q12907 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms