Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms