Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPIBQ01892 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms