Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms